台大歷史博士生吳俊瑩質疑，經過課綱修訂，台灣平埔族的歷史被消滅了。 因為現行法定的「原住民族」，僅阿美族、泰雅族、排灣族、布農族、卑南族、魯凱族、鄒族、賽夏族、雅美族、邵族、噶瑪蘭族、太魯閣族、撒奇萊雅族、賽德克族等十四族，而西拉雅族及其他平埔族皆不是法定的原住民族。 政大台史所所長薛化元認為這是因為檢核小組使用現行法律定義來書寫歷史，造成歷史事實與課綱之間的矛盾。 立法院長王金平認為，立法院已通過《高級中等教育法》，但教育部仍採用舊法作為行政依據，在法律適用上有疑義。 且蔣偉寧時代，已經將課綱修改的行政命令送至立法院備查，雖然教育部認為依照《高級中學法》，課綱屬於行政規範，但若配合《高級中等教育法》中的規定，即使是行政命令也應該送立院備查。
比起民主進度黨政府執政時「去中國化」課綱幅度為小，針對性也不那麼高。 而民主進步黨主導其執政縣市反對調整，是以政治力過度干預學術與教育，給教育部戴上「去台灣化」的大帽子。 國民黨立委洪秀柱認為，這次修改只是扭轉李登輝至陳水扁時期的去中國化修改，使課綱回到中華民國憲法的規範下，調整的幅度仍然太小。
108課綱 內容: 高中版本
檢核小組社會領域公民與社會組的二人組，組員包宗和、朱雲鵬分別為馬英九的兩岸政策核心幕僚與馬英九的財經核心智囊。 朱雲鵬於「檢核小組會議」中更提出「臨時動議」建議由檢核小組直接微調課綱，獲得檢核小組無異議通過。 歷史課綱研訂委員吳昆財表示「不斷浪費時間，教授台灣史，實在令人費解」，以及主張兩岸應合寫歷史教科書，被質疑立場過度傾中。 反課綱微調之人士認為現行高中課綱，在馬英九政府執政前，都是交由課綱委員會決定，課綱委員由大學教授與高中教師組成，並經試教，以驗證內容對於教學的影響。 馬政府執政後，卻無視課綱委員會的決定，並改由檢核小組進行調整，檢核小組成員來源複雜，未具備專業。
- 2.於「認識智慧教室」中，讓民眾明白前瞻基礎建設中的智慧教室，可提供孩子什麼樣的學習環境，對孩子的未來有何裨益。
- 6月25日，台灣科技大學退休教授劉進興、輔仁大學歷史系教授陳君愷等人發起「我是民眾，我反對竄改歷史」搶救歷史教科書連署，獲得超過五千人連署，要求教育部也將他們的意見納入教科書。
- 淡化日本對台灣建設的內容，強調日本殖民統治，日商的經濟壟斷與剝削。
- 這些阿嬤是人權鬥士，20年來願站出來，被人看見，挺身而出，對戰爭性犯罪的反省，對人類進步有很大貢獻，黃淑玲更進一步指出，慰安婦議題在台灣常被當成政治角力工具，也是台灣很多慰安婦議題無法被深入討論的原因，台灣慰安婦阿嬤當時是被強制進入性奴隸制度，沒有離開的自由，也沒有權利決定每天接受多少的士兵。
6月25日，台灣科技大學退休教授劉進興、輔仁大學歷史系教授陳君愷等人發起「我是民眾，我反對竄改歷史」搶救歷史教科書連署，獲得超過五千人連署，要求教育部也將他們的意見納入教科書。 張亞中與王曉波等人也發表決議文反制，要求歷史教科書編撰應謹守憲法，避免造成一中一台或兩國論的史觀。 11月，教育部發函公告98課綱延緩至2010年（民國99年）實施，改稱「99課綱」。 國文、歷史兩科，沿用95暫綱的內容，正式修改及實施的時間另外公告。 「99課綱」的其他科目同樣也有微調，如2013年7月完成數學與自然領域課程綱要微調。 2008年10月，總統馬英九執政後，教育部長鄭瑞城召開「普通高級中學課程發展委員會第十八次會議」。
108課綱 內容: 課程綱要
從下表可以看出108課綱部定必修大幅縮減，增補了校定必修、彈性學習、團體活動，代表在新課綱的制度下，學生在修習課程上擁有更多的選擇權。 108課綱 內容 每所高中可以依據課綱設定自己的校定必修，或是開設不同的選修課，學生在選擇的層面上更多。 所以儘管都是高中生，或是在同一所學校，每位學生也不一定會有同樣的選修，甚至能透過課程展現個人的興趣與特質，這也代表學生需要更深思熟慮地去擬定自己在高中三年的課程規劃。 除了原先的七大領域（國文、英文、數學、自然與生活科技等等），108課綱還新增了科技領域，希望培養學生的運算邏輯思維、批判語創造思考，還有問題解決能力，內容包含：程式設計、設計的應用、演算法等課程。 「如果真的不喜歡那些有的沒有的活動，你就專心拚繁星；繁星沒有，就去分科」。 李瑞霖也提醒，即便是熱愛活動的人，也不要花太多時間做學習歷程檔案，因為最後仍可能面臨檔案不被看到的風險。
首屆課綱生的旅程結束了，然而上萬學子仍在學習歷程檔案的迷宮裡徘徊；但這次，他們並非無所適從，前輩的經驗如同希臘神話中的那捆線團，成為後輩的指引，幫助他們順利前往屬於自己的出口。 有學生則提出另一種思考角度，廖宥甯回想與學妹的對話，那時她剛考完大學，回學校與高一、二的學妹們分享經驗，有人就問她「學姐，那個有用嗎？」、「讀資優班這件事大學面試會有用嗎？」。 日復一日的小考、報告，一學期三、四次的段考風暴對台灣學子而言早就習以為常。
108課綱 內容: 社會觀點
李瑞霖以自身選課經驗比擬，不同老師對探究實作課程的理解及準備，將決定學習歷程能否「端上檯面」。 像是曾有一堂課老師要求學生扮演候選人探索家鄉優勢，提出改變策略模擬選戰，但老師卻未深入教學生制訂政策、了解政治背後意涵，儘管課堂娛樂性質高，但他坦言學習歷程對社區高中更像是殘酷的「師資抽抽樂」。 108課綱上路以來，教團、學生家長質疑聲浪不斷，都市與社區、偏鄉高中資源相差甚遠，多元選修開設不夠多樣，學習資源、硬體設備不足，明星、社區高中兩者間的資源註定存在先天差異？ 近來，六都明星高中積極和大學端結盟，包括台北市五校聯盟、高雄市五校彈性學習聯盟、台南市四校聯盟、桃園市頂尖教育計畫，皆開設特定課程供學生跨校選修；社區高中學生在這方面則較遜色，校內若無主動提供的資源，就需自尋其他管道。
民進黨主席蔡英文也認為此次爭議的主要問題，在於課綱修改程序不正當，特別是修改過程中的相關資訊未公開。 甘懷真在《歷史研究》中發表〈臺灣與日本的中學歷史教科書之比較〉論文，以日本中學歷史教科書為例，主張成立常態性教科書審議委員會，來審查教科書；開放更大權限給教科書編寫者，同時重視歷史分期。 台大國發所教授劉靜怡建議應完全取消課綱的設計，開放教科書自由編寫。 108課綱 內容 台大歷史系教授陳翠蓮也認為，表面上的「字句修正」固然是一個爭論點，比如外界聚焦於慰安婦是否被迫、日治或日據，但其實是新課綱的論述過程有爭議，集中在戰後台灣史，強化與中國大陸連結，而弱化國際性。 名嘴黃智賢表示，有出版社，因為意識型態和種種原因，根據101課綱編寫教科書的時候，居然在課綱沒有規定的漏洞裡，寫出很離譜的教科書，現場教學的歷史老師和外界，把這種離譜的狀況回饋到課綱微調小組，所以在課綱微調的時候，才被逼得要面對這種離譜的處境。
108課綱 內容: 學習歷程難在哪
但105學年度下學期之後，至107年十二年國教課綱接上來的過渡時期，則需使用101課綱版本。。 108課綱實施後，根據金車文教基金會調查顯示，僅有兩成教師表示全面準備就位，但也有四成教師認為新課綱對學生有幫助。 金車文教基金會曾清芸總幹事分析，新課綱很多課程時數減少，但教學內容仍無法對應到目前包山包海的考試制度，老師的壓力大。 教育部長潘文忠坦言，108課綱課程的規劃確實有太多細節、配套，除了調整師資人力結構、公布實施偏遠地區學校發展條例，也因應新課綱的科技領域，前瞻計畫也投入100億於校園的智慧化中。
7月23日早上7時，北區反課綱高校聯盟成員許冠澤，周子翔於教育部前展開預計25天的「徒步環島反課綱」活動。 2月14日，數個臺灣原住民族團體聯合召開記者會，要求把制定課綱的權利，還給原住民族，拒絕政府繼續以殖民心態對待原住民族。 12月27日，教育部公布高級中等教育法施行細則，並依高級中等教育法第67條之規定，將實施時間定為2014年8月1日。 7月10日，立法院通過《高級中等教育法》，其中關於課綱訂定程序及課審會組成之條文則自103年8月1日施行。 自主行動：個人是學習的主體，學習者應選擇適當的學習方式，進行系統思考以解決問題，並具備創造力與行動力。
108課綱 內容: 微調過程
北區反課綱高校聯盟總召朱震亦坦承，該場活動確實有和民進黨、台聯等政黨合作，並表示因為學生力量不足、資源不夠，所以他們使用綠黨的辦公室開會，路權從台聯借來，活動對講機是向民進黨借，抗議當天也有請社民黨的立委參選人苗博雅在舞台旁向大家致意。 不過朱震強調，並非只接受某一方面或特定立場的挹注，基本上只要願意幫助他們進行活動者，都樂於接受其幫助。 2月28日，為抗議高中課綱微調違反程序正義，公民覺醒聯盟與公民教師行動聯盟發起兩天一夜的『228翻轉教室 – 108課綱 內容 街頭公民課』，街頭抗議靜坐活動。 估計上百人參與靜坐、公民論壇及晚會，其中5位公民老師更展開飢餓28小時靜坐，以行動表達抗議。。
108課綱的全名是「十二年國民基本教育課程綱要」，從108年９月正式上路，108學年度的小一、國七和高一新生都會用新課綱上課。 108課綱上路後，不再只是單純背誦記憶的考題，而是將題目拉長，並且變得更生活化、情境化，甚至結合不同領域的學科在同一題目裡，考驗學生跨域連結的能力，需要理解與思考才能在學測時拿下高分。 現在國中的數學課已被准許使用計算機，因為學生要學的並不是單純的計算，而是數感的培養，擁有估算、解決問題還有良好的邏輯推理能力。
108課綱 內容: 學習階段
反對立場的學者及民眾，認為該調整對臺灣史中特定議題有大幅度變更，也引發歷史教育學界及政界中的爭議。 108課綱 內容 國文科、公民科與地理科等課綱內容也被做出修正，但是其幅度不大，引起的關注也相對較低。 「普通高級中學語文及社會領域課程綱要微調」是馬英九政府執政時，中華民國教育部對101課綱語文、社會二領域課程綱要的調整，於民國102年（2013年）通過。
此外，現行高中課綱，在馬英九政府執政前，都是交由課綱委員會決定，課綱委員由大學教授與高中教師組成，並經試教，以驗證內容對於教學的影響。 但立法委員林奕華與李貴敏皆主張，有關課綱微調的啟動時間為2013年，應適用當時的「高級中學法」，而民進黨指稱的「高級中等教育法」第43條依同法第67條之規定至2014年8月1日才正式施行，當時課綱微調的法律程序已經結束，所以時間點上並無違法情事。 人智學教育基金會董事長嚴長壽則認為，歷史本來就不是個選擇題，也不是個是非題，應是個申論題，今後老師們教學時可要更著重在「不是以標準答案來答覆所有問題」，反過來應該讓學生自己去尋找答案，讓學生有思辨能力，之後判斷是非對錯，做出選擇與看法。。 7月23日，在教育部前抗議的學生團體成員及自由時報等3位記者，運用鋁梯越過教育部北邊福利社屋頂入，進入教育部部長辦公室，並破壞公物、架住值勤人員。
108課綱 內容: 學習歷程四關卡
Eileen同樣持相似論點，並表示學習歷程檔案能記錄自身的成長。 高三回首為升學所做的努力時，透過製作的報告，可以看到自己的進步，例如更懂得擷取重點、PPT做得更精緻。 學習歷程檔案之旅自高一展開，每學期、學年的製作和上傳成為學生放不下的心頭懸念，究竟該如何「打怪」，幾名學生分享了他們的妙方。
她並拋出「反『有用無用』」的思考，表示太早預設立場會喪失許多探索的機會，因為有時「看起來」無用的事情，真正做了之後，反而能帶來許多收穫。 不過兩人指出，自主學習時間一個禮拜頂多兩堂課、兩小時的時間，若要在計畫上做足功夫，勢必得花到額外的時間，去找資料、處理額外的事物。 2.於「認識智慧教室」中，讓民眾明白前瞻基礎建設中的智慧教室，可提供孩子什麼樣的學習環境，對孩子的未來有何裨益。 一逛到這個學校的時候，學校的孩子們立馬上前來打招呼，並且和我分享他們在學校的所做所學，口條之好，讓我一下子就清楚又明白學校的特色課程。 這場由專業教師領軍的展出，在展場中可與教師互動，相信不管是對108新課綱或對孩子的學習，都能有更有更進一步的認識。 降低國文文言文占比：文言文占比由 45%~65% 調整為 35%~45% ，更著重培養孩子對於長篇文章的閱讀能力。
108課綱 內容: 歷史
108課綱最核心的概念「素養」，強調學習不侷限於學科知識、技能，而應關注學習與生活的結合。 然而「素養」兩字概念模糊，6名受訪者表示，不僅學校老師說不清，就連每位學生的解讀都不同，有人認為素養來自自身的底蘊、是批判性思考或思辨能力、是面對未來挑戰所應具備的知識及能力，亦是「斜槓人生」的養成。 和多數同學相似，高一時期志願未定的陳柏宇坦言，即使學校開的課已經很多，但高中三年來身邊同學仍會抱怨校內社會人文、生醫等類群課程開課不均，因此在資源許可的情況下，他轉向選擇跨校選修包括台中一中、科博館的課程。 其中，在科博館空汙課程的帶領下，陳柏宇開始對相關領域好奇，著手展開自主學習的偉大藍圖，迎來意想不到的「巨大轉折」。
108課綱 內容: 臺灣時期
教育部認為檢核委員的專業足以適任，王曉波在接受訪問時，稱自己擁有豐富台灣史專業，出版多部專家。 但是歷史學界中有人提出批評，如台大歷史系教授吳密察批評王曉波不曾在國際被認可的歷史專業期刊上發表過論文，其史學能力存疑；政治大學歷史系金仕起教授認為這次微調案的主要成員，如王曉波，其歷史專業不受專業歷史學者的認可；而黃麗生與李功勤等人雖為歷史專業，但其史觀落後主流學界。 全台灣有139位歷史學者，連署反對這次非專業的調整案，其中多數為台灣史學者。 但教育部長吳思華與檢核小組成員王曉波等人，皆認為課綱微調案的修改程序跟之前並沒有兩樣。
然而非都市地區高中學校並非無解，發展屬於當地特色的課程，加上教師的投入及帶領同樣能讓學生有感。 陳威良回憶，一堂地理選修令他相當印象深刻，課堂上同學們矇著眼、踩著學校的草地，在老師的帶領下走進鄉鎮的每條路，記錄下自己的所見所聞。 「一開始以為就是讀書或是講講地理知識，選擇之後才發現，內容跟『體感大自然』比較有關係」陳威良認為，這樣的選修課程使讀書不再侷限於課本中，更讓他有了美感、欣賞藝術的能力，提升內在軟實力。 108課綱 內容 ：2014年2月10日由中華民國教育部部長蔣偉寧核定的高中課程綱要歷史科部分，內容包含與前一版本（即九五課綱，文件中稱現行課程綱要）對照。 他認為，根據微調後的課綱編寫的教科書，必須寫清楚「我國第一大島是台灣島，而不是海南島；我國最高山是珠穆朗瑪峰，而不是玉山；台灣慰安婦一定是被迫的。」其目的在於掃除文化台獨與皇民化思想，在史觀上回歸兩岸同屬一個中國的憲法一中原則。
呂為蓁也建議參與的活動盡量符合自身類組或未來預計就讀的科系，她指出，有些學生會特地花錢參加各色活動，最終活動卻不一定與申請科系相關，「變成說當時走的都是冤枉路」。 呂為蓁認為，雖然學生高一、二時多數懵懂，但還是要有想法，「不要跟自己的期望相差太大。不然做那麼多，到時候回頭看，其實是會有點浪費時間」。 受訪者們多認為學習歷程和段考的兼顧其實有難度，因此平日的積累、記錄相當重要，並妥善分配兩者的準備時間。 像是陳威良會利用讀書的休息時間，留半個小時製作學習歷程檔案，或在預知段考時間的情況下，趕在之前先完成學習歷程檔案。 至於作為首屆108課綱高中生，在過去無跡可循的窘境下，回顧高中三年上傳的多份學習歷程檔案，究竟提交給大學端的取捨原則為何？
國民黨立委蔡正元在臉書回應，中華民國憲法或法律都沒有規定首都在哪裏。 前台北市議員楊實秋則引述1982年蔣經國時期與薩爾瓦多簽訂科學合作協定時，協定內文載明「訂於中華民國首都臺北」，質疑王曉波的說法。 108課綱 內容 另外，反課綱群眾亦向台北高等行政法院聲請假處分，要求高中課綱修正不得於2015年8月1日實施。 但法院於審理後認定，請求事項涉及法規命令是否應修正及如何修正範疇，非行政訴訟法所稱的公法上法律關係，而駁回反課綱群眾的假處分聲請。。
他過去是沉默大眾，但社會應該要有不同的聲音，但現在只剩下一種聲音，應該站出來，表達另一種聲音，台大農經系大一學生劉昱佑則認為，民進黨主席蔡英文把政治黑手伸進教育專業，是錯誤的示範，政黨不該破壞民主法治。 108課綱 內容 2月20日，台灣永社並認為教育部長蔣偉寧在1月主持的課審會議程記錄中，寫下高中分組會議「同意」公民課綱微調，但與會者會後轉述，會議內容應是「不同意」微調。 108課綱 內容 台灣人權促進會去函教育部與國家教育研究院要求公開課審會議成員名單、完整會議及投票紀錄。
如何將素養融入學習歷程中也是陳威良當時最大的不安來源，不僅在文字上更著重於當下「領悟」，他以地理選修為例，照片挑選上會使用「一看就知道我們在幹嘛」的圖片，讓閱讀的人更了解學習歷程中的「歷程」究竟為何。 108新課綱適用於92年9月1日以後出生的孩子，這些孩子將以「素養導向」為評測方式。 108課綱實施至今3周年，全國教師工會總聯合會今天提出4項建議，如課綱與考招的連動性應全面檢討，呼籲教育部立即實打實解決問題，不要再講空話。
缺乏完善配套，學習歷程檔案的新制招致罵聲；然而，即便學習歷程檔案被批評的一無是處，還是有學生看見它的好。 陳柏宇認為，學習歷程檔案有兩個優點，一個是隨時都能上傳保存，不用擔心資料會不見。 第二點則是系統強迫學生思考「這學期是不是該做些什麼東西了呢？」，成為把學生往前推的助力，讓學生去探索、知道自己該往哪個方向走。
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